12 - هدى العقول في شرح أحاديث الأصول في 15 مجلد حجري .
13 - مشكاة الأنوار في رجعة محمد وآله الأطهار .
د - علم الهيئة والحساب :
1 - شرح تشريح الأفلاك للبهائي في الهيئة .
2 - خلاصة الحساب .
ه‌ - علم الكلام المقارن :
1 - الشهب الثواقب لرجم شياطين النواصب ، وهو الكتاب الذي بين يديك وسيأتي الحديث عنه مفردا .
2 - مفتاح الخزائن ومصباح الدفائن وهو نفسه تحفة الأخوان للرد على سائر الأديان .
3 - الرد على النصارى ، صغير في مجلد ، وكبير في مجلدين [1] .
هذا هو الشيخ باعتبار الكم ، وأما الشيخ باعتبار الكيف فإنه قد أبدع في كثير من البحوث التي طرحها ، وبما أنه يتميز بفكر حر فقد مكنه من أن يناقش كل فكرة تطرح من أي مفكر أو عالم كان ، ولم تأخذه حمية العصبية في شئ من ذلك ، بل بمقتضى ما وهبه الله من قدرة علمية يناقش فيحل ويعقد ، ويجيب نقضا وحلا ويلزم كل مفكر بما يراه من لوازم فكرته دون مواربة أو خوف من أحد إلا الله عز وجل . فقد ناقش من علمائنا المتقدمين الشيخ المفيد والسيد المرتضى والعلامة ومن المتأخرين أو المعاصرين له كالمجلسي وصدر الدين الشيرازي وصاحب القوانين والخوانساري وغيرهم .

[1] قد ترجم لكل هذه الكتب والمؤلفات في مقدمة كتاب ( ثلاث رسائل ) .

34