تلوث مياه الأمطار مسألة : يجب حماية مياه الأمطار والمياه الجوفية من التلوّث ، فان من طبيعة الأمطار أن تطهّر الهواء من الملوثات كالنتروجين والكبريت وذرّات التراب وغيرها ، وتتركز هذه الملوثات في المياه الجوفية . وتذوب الملوثات الغازية التي تنفثها المصانع الحديثة بسبب مياه الأمطار أثناء سقوطها مما يؤدي إلى تلوّث المسطحات المائية والتربة التي تتساقط عليها هذه المياه . والتلوث من الأمطار يكثر في المناطق الصناعية ، أما تلوث المياه الجوفية ، فإنها تتعرض للتلوث جرّاء تسرب المواد الكيماوية إليها أو أنها تتلوث نتيجة تسرب مياه المجاري إليها ، أو تسلل مياه الأمطار الحمضية إلى الطبقات التحتية التي تكون مخزنا واسعا تحت القشرة الأرضية ، كما تتلوث المياه الجوفية ببعض المعادن والأملاح التي توجد في صخور الطبقات الحاملة لهذه المياه . ولذلك أصبح من الضروري حماية الماء من الملوثات ، مثل معالجة مياه المجاري قبل تصريفها إلى المسطحات المائية . ومثل تطهير مياه الشرب باستعمال الأوزون أو الكلور أو الأشعة فوق البنفسجية . ومثل استعمال الوسائل الميكانيكية بتجميع النفط الطافي والعائم فوق سطح الماء . ومثل التخلص من الطحالب والنباتات المائية الملوثة لمياه الأنهار بالوسائل