توجد منهجيتان للبحث في القرآن الكريم هي:

المنهجية الأُولى: المنهجيّة الترتيبيّة

وهي منهجيّة تناول الآيات القرآنيّة بحسب ترتيبها في المصحف، أو بحسب ترتيب نزول الآيات والسور، ولكُل واحد من هذين النمطين أُسلوبه الخاص في البحث.

فأمّا أُسلوب البحث في التفسير بترتيب المصحف، فينظر فيها إلى القرآن كمقطع واحد، أي: بمعنى مجموعة متسلسلة من الآيات المنتظمة في المصحف الشريف، وتعطى فيه بناءاً على ذلك مكانة خاصة للسياق وترتيب الآيات والسور القرآنيّة.

وبما أنّها تعتمد على بحث آية آية، فيمكن فيها اتباع نفس طريقة البحث في الآية الواحدة الآنفة الذكر، ولكن مع الأخذ بنظر الاعتبار:

1- ضرورة قبول الترتيب الحالي للآيات والسورة القرآنيّة في المصحف الحالي، والإقرار بأنّه هو الترتيب الّذي كان في زمن النَّبيّ محمّد صلى الله عليه وآله وسلم، وكنتيجة لقبول هذه الضرورة نرى بعض المفسِّرين كالطبرسي في مجمع البيان قال بارتباط آخر كُل سورة بأوّل التي تليها، ومثال ذلك قوله في أوّل تفسير سورة البلد: «لمّا ختم الله تلك السورة بذكر النفس المطمئنّة، بيّن في هذه السورة وجه الاطمئنان، وأنّه النظر في طريق معرفة