باقر بن المقدس السيد حيدر ، حيث قرأ عليهما النحو والصرف ، والشيخ العلامة أحمد العطار قرأ عليه المعاني والبيان والبديع ، والشيخ محمد بن الحاج كاظم والميرزا باقر السلماسي قرأ عليهما المنطق .
كما قرأ الفقه والأصول على يد والده رحمه الله . وما ان بلغ الثامنة عشر من عمره حتى خرج من سطوح الفقه والأصول .
وفي هذه المرحلة بالذات قد ( فشى ذكره في التحصيل على ألسنة الخاصة والعامة من أهل بلده ، ورن صيته بالعقل والفضل والهدى والرأي وحسن السمت في تلك الناحية ، فكان المثل الاعلى من شباب الفضيلة ، في حمد السيرة وطيب السريرة ، وجمال الخلق وكمال الخلق ) [1] .
2 - رحل إلى مدينة النجف الأشرف عام ( 1290 ه‌ ) لاكمال دراسته في جامعتها العلمية ( الحوزة ) ، فبدأ بدراسة علمي الكلام والحكمة على يد المولى الشيخ محمد باقر الشكي ثم على المولى الشيخ محمد تقي الكلبايكاني والشيخ عبد النبي الطبرسي ، وقد تميز رحمه الله في هذه المرحلة بجدية فائقة حتى أشير إليه بالبنان من قبل العلماء الأعلام ( وقد نوه شيوخ الاسلام أساتذته باسمه ، وشادوا بفضله ، مصرحين بعروجه إلى أوج الاجتهاد ، وقدرته على استنباط الأحكام الشرعية الفرعية عن أدلتها التفصيلية ) [2] .
3 - انتقل إلى مدينة سامراء عام ( 1297 ه‌ ) حيث التقى بالمجدد الكبير الامام الشيرازي الذي ارتحل إلى هناك من قبل عام ( 1291 ه‌ ) . وقد حظي الطالب المجد بمكانة عند سيده الأستاذ [3] حيث اهتم به اهتماما متميزا ، وخصه بالمذاكرة والمباحثة كما أكد ذلك شرف الدين رحمه الله حيث قال :
( وكنت أيام هجرتي العلمية إلى سامراء وذلك سنة ( 1310 ه‌ ) أرى المقدس الميرزا محمد تقي الشيرازي يبكر في كل يوم إلى بيت السيد للبحث ثم ينصرف إلى درسه العام

[1] بغية الراغبين في أحوال آل شرف الدين للسيد عبد الحسين شرف الدين انظر تكملة أمل الآمل : 14 .
[2] الكنى والألقاب ، 3 : 36 .
[3] تكملة أمل الآمل : هامش الصفحة : 18 .