تعداد اين قرآنها فزونى يافته وكتابهاى ديگرى از قبيل كتب حديث وتفسير هم بر آنها افزوده شده است . در اواخر سده ء دهم هجري ، كتابخانه ء داراى كتابهاى بسيار وگرانبهايى بوده است . اين كتابخانه ء اولين كتابخانه أي است كه در ايران به نشر فهرست اقدام كرده است . نخستين فهرست ، در زمان نيابت توليت ميرزا سعيد خان انصاري ، تدوين وذيل جلد دوم مطلع الشمس چاپ شد .
دومين مجلد اين فهرست به دستور محمد وليخان اسدي - نيابت توليت وقت - در 1305 ه‌ .
ش ، منتشر شد . مجلد اول ، در چاپ دوم ، توسط سيد على اردلان جوان : تحقيق وباز نگارى شده است .
تاكنون يازده جلد از اين فهرست منتشر شده است .
مجلد اول ( چاپ اول ) تأليف افسر ، شيخ محمد خالصي ، مرتضى قليخان نائينى ، حاج عماد المحققين واعظ تهرانى معروف به ( عماد فهرستى ) ، ميرزا على اكبرى شهيدى ثقة الاسلام ، واوكتائى ، چاپخانه ء نو بهار ، تير 1305 ه‌ . ش ، 96 + 24 + 52 + 76 + 12 + 108 + 32 + 22 ص . ، رحلى .
در آغاز ، پيشگفتارى از اوكتائى - رئيس وقت كتابخانه ء آستانه ء مقدسه - در مورد آستانه ء مقدسه وكتابخانه ء آن ، ومقدمه أي درباره ء علم الهى و . . است .
اين مجلد ، شامل كتب خطى وچاپى ، به اين ترتيب : * كتب خطى حكمت وكلام وتصوف ( 12 - 95 ) * كتب چاپى حكمت وكلام وتصوف ( 1 - 23 ) * كتب خطى منطق ( 1 - 50 ) * كتب خطى تفسير ( 1 - 47 ) * كتب چاپى تفسير ( 1 - 9 ) * كتب خطى اخبار ( 1 - 105 ) * كتب چاپى اخبار ( 1 - 32 ) .
ترتيب معرفى : شماره ء راهنما ، كتابشناسى ، ونسخه شناسى .
تنظيم معرفى نامه ها : الفبايى .
اضافات :
1 . غلطنامه ( 1 - 21 ) .
مجلد اول ( چاپ دوم ، ويرايش دوم ) تحقيق وبازنگارى سيد على اردلان جوان ، انتشارات كتابخانه ء مركزي آستان قدس رضوى ( ع ) ، شماره ء 12 ، بهمن 1365 ه‌ . ق ، 748 ص . ، وزيرى .
در آغاز ، بعد از تقديم كتاب به مناسبت نهمين سالگرد انقلاب اسلامي ايران ، مقدمه أي از ر . ع . شاكري - سرپرست كتابخانه ء مركزي آستان قدس - در مورد تجديد چاپ اين مجلد ، وپيشگفتارى از مؤلف درباره ء ويرايش دوم كتاب ، وتوضيحات راجع به علائم اختصاري اين فهرست است .
اين مجلد شامل نسخ خطى به اين ترتيب است : * حكمت وكلام وعرفان ( 25 - 254 ) * منطق ( 257 - 397 ) * تفسير ( 401 - 599 ) .
ترتيب معرفى : شماره ء راهنما ، كتابشناسى ، ونسخه شناسى .