نسخ ( الفوائد الحائرية ) : اعتمدنا على مخطوطتين من مجموعة المخطوطات الكثيرة المتواجدة في ثلاث مكتبات في قم وطهران : المخطوطة الأولى وهي الأحسن نسخا والأقل أخطأ ، مستنسخها محمد بن رضا بن أبي القاسم عام 1241 - 1261 ، وفي نهايتها تصريح بالمقابلة بواسطة محمد حسن بن الحاج علي عام 1270 . وهي موجودة في مخطوطات مكتبة المسجد الأعظم التي أسسها آية الله العظمى السيد البروجردي قدس سره ، ورمزنا لها ب ( ف ) . والمخطوطة الثانية هي إحدى مخطوطات الفوائد الحائرية في مكتبة آية الله العظمى السيد المرعشي النجفي قدس سره وتاريخ استنساخها 1242 ، وهي أردأ خطا وأكثر أخطأ ، ورمزنا لها ب ( م ) . وهناك نسخة ثالثة مطبوعة للفريد الگلپايگاني ، استفيد منها أيضا في بعض الموارد بشكل نادر . منهجنا في التحقيق : ويتلخص في ما يلي : 1 - الاستنساخ وتقطيع النص . 2 - تقويم النص . وقد حذفنا عند اختلاف النسخ الموارد المقطوع بخطأها وأبقينا كل مورد يحتمل فيه الصحة ، وقدمنا الأنسب للعبارة أو الأصح وأثبتناه في المتن وجعلنا الثاني في الهامش . 3 - استخراج الآيات والأحاديث وأقوال الفقهاء من مصادرها .