احتجز جهيمان وجماعته كل من كان داخل الحرم، بما فيهم النساء والأطفال ثلاثة أيام، وبعد ذلك أخلى جهيمان سبيل النساء والأطفال فقط.. وبقى عدد لابأس به من المحتجزين داخل المسجد.

وفي النهاية.. حاولت الحكومة السعودية منذ اللحظات الأولى حل هذه المشكلة وديا مع جهيمان.. بالاستسلام، والخروج من الحرم، وإطلاق سراح الرهائن المحتجزين، إلا أنه رفض.

عطلت الصلاة والمناسك في البيت الحرام، وتبادل الطرفان إطلاق النيران الكثيف، وأصاب المسجد الحرام ضرراً بالغاً جرّاء هذه الأحداث، وعندما نفد صبر الحكومة السعودية، تدافعت قواتها معززة بقوات الكوماندوز، في هجوم شامل، واستخدمت فيه تقنيات عسكرية جديدة، لم يعهدها جهيمان وأتباعه، فسقط منهم الكثير..